อาสาสมัคร
วิเคราะห์ตัวอย่างทั้งหมด 116 ตัวอย่างจาก 60 ผู้ป่วย ในสี่วิชาของกลุ่ม MFP ตัวอย่างย่อยไม่สามารถรวบรวมได้ใน 6 สัปดาห์ด้วยเหตุผลโลจิสติกที่แตกต่างกัน ก่อนหน้านี้แผนภาพการไหลของมเหสีได้รับการรายงานอย่างละเอียด (Vasconcelos et al., 2024) ไม่พบความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญในแง่ของอายุเพศและนิสัยการสูบบุหรี่ระหว่างสองกลุ่มการรักษาที่พื้นฐาน (ตารางที่ 1) ไม่มีความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญในดัชนีคราบจุลินทรีย์หรือมีเลือดออกในการตรวจสอบที่ไซต์ตัวอย่างถูกพบระหว่างกลุ่มที่พื้นฐานหรือ 6 สัปดาห์ อย่างไรก็ตามความแตกต่างของ intragroup อย่างมีนัยสำคัญพบระหว่างพื้นฐานและ 6 สัปดาห์ที่ระดับไซต์ในทั้งสองกลุ่ม (ตารางที่ 2)
สรุปข้อมูลการเรียงลำดับ
หลังจากการควบคุมคุณภาพมีการตรวจพบ phylotypes 7,791 ครั้งสุดท้าย ตัวอย่างถูกรวมกันมากถึง 3,240 อ่านเพื่อปรับขนาดตัวอย่างให้เท่ากันและอำนวยความสะดวกในการเปรียบเทียบเชิงปริมาณ มีการตรวจสอบตัวอย่างทั้งหมด 115 ตัวอย่างสำหรับการวิเคราะห์ความหลากหลายเนื่องจากตัวอย่างจากผู้ป่วย #29 ที่พื้นฐานจะต้องถูกลบออกเนื่องจากการสุ่มตัวอย่างเชิงลึกไม่เพียงพอ เส้นโค้งการหายากแสดงให้เห็นถึงความลึกของการเรียงลำดับที่ดีและขนาดย่อยที่เหมาะสม (ดูรูปที่ 1 เพิ่มเติม)
ผลรวมของการแปรงสีฟันต่อ microbiome subgingival
มากกว่า 98% ของความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์เป็นผลมาจากแปดสายไฟที่สำคัญรวมถึง Bacteroidota (27.91%),, Fusobacteriota (20.37%),, เครื่องราง (19.37%),, โปรตีโอแบคทีเรีย (10.19%) Actinobacteriota (9.40%), spirochaetota (5.46%) Campilobacterota (3.24%) และ Patescibacteria (2.77%) phyla อื่น ๆ คือ Synergistota (0.73%) desulfobacterota (0.36%) คลอโรฟิลออกอตา (0.12%) และ verrucomicrobiota (0.05%) เมื่อ 6 สัปดาห์ที่ผ่านมา microbiome ยังคงถูกครอบงำโดย Bacteroidota (25.72%) ตามด้วย เครื่องราง (22.13%) และ Fusobacteriota (19.70%) (ดูตารางเสริม 1)
ในระดับสกุล ฟูโนแบคทีเรีย (16.47%) เป็นสกุลที่มีมากที่สุดตามด้วย Prevotella (10.07%) capnocytophaga (6.08%) และ Treponema (5.46%) จำพวกอื่น ๆ ที่มีความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์ porphyromonas (4.32%) leptotrichia (3.68%) สเตรปโตคอกคัส (3.30%) Campylobacter (3.23%) Veillonella (3.07%) Actinomyces (2.90%) โรที (2.78%) corynebacterium (2.44%) Neisseria (2.12%), F0058 (1.94%) Haemophilus (1.82%) alloprevotella (1.81%) การรวมตัวกัน (1.77%) selenomon (1.60%) Tannerella (1.59%) คาร์ทิโอแบคทีเรีย (1.47%) enterococcus (1.38%) SaccharimaDaceae (1.31%) และ ด่าง (1.27%) ในตอนท้ายของการศึกษาเจ็ดอันดับแรกในความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์ยังคงเป็นที่แพร่หลายมากที่สุดโดยไม่มีการเปลี่ยนแปลงที่สำคัญในสัดส่วนของพวกเขา ข้อมูลความชุกของจำพวกทั้งหมดที่ระบุไว้จะแสดงในตารางเสริมที่ 1
ในระดับสปีชีส์สปีชีส์ที่แสดงความชุกสูงสุดในผู้ป่วยที่มีการอักเสบเหงือก Fusobacterium nucleatum (7.51%) และอื่น ๆ ฟูโนแบคทีเรีย spp. (8.88%) สายพันธุ์อื่น ๆ คือ Veillonella spp. (2.81%) โรที spp. (2.26%) Campylobacter gracilis (2.19%) Corynebacterium matruchotii (2.07%), F0058 แบคทีเรียที่ไม่ได้รับการเพาะปลูก (1.94%), Actinomyces spp. (1.91%) สเตรปโตคอกคัส spp. (1.85%) ค่าเฉลี่ย Treponema (1.45%) Porphyromonas gingivalis (1.38%) porphyromonas endodontalis (1.35%) Prevotella Nigrescens (1.34%) Haemophilus parainfluenzae (1.32%) ด่าง spp. (1.27%) capnocytophaga gingivalis (1.25%) capnocytophaga ochracea (1.23%) Prevetella Intermedia (1.23%) Alloprevotella Tannerae (1.22%) enterococcus spp. (1.14%) Treponema Socranskii (1.08%) Treponema denticola (1.05%) prevetella denticola (1.04%) คาร์ทิโอแบคทีเรีย แบคทีเรียที่ไม่มีการเพาะปลูก (1.04%) และ Tannerella Forsythia (1.02%) หลังจาก 6 สัปดาห์สายพันธุ์ของ ฟูโนแบคทีเรีย ยังคงครอง microbiome (15.11% ของทั้งหมด) ตามด้วย C. matuchotii (2.81%) Veillonella spp. (2.55%) และ สเตรปโตคอกคัส spp. (2.43%) ข้อมูลความชุกของสปีชีส์ทั้งหมดที่ระบุจะแสดงในตารางเสริมที่ 1
ความหลากหลายของอัลฟ่าและเบต้าของ microbiome subgingival โดยการเยี่ยมชมและกลุ่มยาสีฟัน
ที่พื้นฐานตัวอย่างจากกลุ่ม CPC/CYM และ MFP มีระดับความร่ำรวยของสปีชีส์ในระดับใกล้เคียงกัน (จำนวน ASV ที่สังเกตได้) และความสม่ำเสมอ (ดัชนีความสม่ำเสมอของ Pielou)P = 0.907 และ P= 0.136 ตามลำดับ) เมื่อ 6 สัปดาห์ที่ผ่านมาจำนวน ASV ที่สังเกตได้เพิ่มขึ้นในทั้งสองกลุ่มและความสม่ำเสมอของชุมชนลดลงในกลุ่ม MFP แต่ความแตกต่างไม่มีนัยสำคัญทางสถิติ (P = 0.740 และ P = 0.585 ตามลำดับ) ปฏิสัมพันธ์ระหว่างเวลาและยาสีฟันไม่พบผลกระทบอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติต่อความร่ำรวยของสปีชีส์หรือความสม่ำเสมอ (P = 0.701 และ P = 0.084 ตามลำดับ) นอกจากนี้ยังไม่มีความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญระหว่างการเข้าชมพื้นฐานและการเยี่ยมชมครั้งสุดท้ายในจำนวน ASV ที่สังเกตได้ (กลุ่มทดสอบ P= 0.424; กลุ่มควบคุม P= 0.195) หรือดัชนีความสม่ำเสมอของ Pielou (กลุ่มทดสอบ P = 0.325; กลุ่มควบคุม P= 0.151) (รูปที่ 1)
การเปรียบเทียบชุมชนย่อยระหว่างยาสีฟัน การวิเคราะห์ไม่ได้แสดงความแตกต่างใด ๆ ในตัวชี้วัดความหลากหลายαที่ระดับ phylotype ความร่ำรวย (สังเกตลำดับของแอมพลิฟายเออร์, ASVs) (อัน) และความสม่ำเสมอ (ดัชนีความสม่ำเสมอของ Pielou) (ข– กลุ่มการรักษา: CPC/CYM, ยาสีฟันกับ Cetylpyridinium Chloride (CPC) และ Cymenol (CYM) เป็นส่วนผสมหลัก MFP, ยาสีฟันที่มีโซเดียม monofluorophosphate (MFP)
ในการระบุการเปลี่ยนแปลงในโครงสร้างของแผ่นชีวะชีวภาพหลังจากใช้ยาสีฟันที่ได้รับมอบหมายตัวอย่าง 115 ตัวอย่างถูกจัดกลุ่มเป็นสี่จุดเวลาโดยใช้ PCOA ขึ้นอยู่กับความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์ของ phylotypes (รูปที่ 2) ไม่พบการเปลี่ยนแปลงระหว่างสองกลุ่มในช่วงระยะเวลาการศึกษา นอกจากนี้ยังไม่มีการตรวจพบความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญในการวัดความหลากหลายของเบต้าระหว่างการเยี่ยมชมพื้นฐานและ 6 สัปดาห์สำหรับทั้งสองกลุ่ม (P2).
ไม่พบการเปลี่ยนแปลงในชุมชน subgingival ระหว่างหรือภายในกลุ่มที่อยู่บนพื้นฐานของการวิเคราะห์พิกัดหลัก (PCOA) หรือตัวชี้วัดที่แตกต่างกันเช่น unifrac ถ่วงน้ำหนัก (อัน) และเบรย์เคอร์ติส (ข) ระยะทาง ตัวอย่างทั้งหมดถูกพล็อตในสององค์ประกอบหลัก (พีซี) สองชิ้นแรกของโปรไฟล์ phylotype กลุ่มการรักษา: CPC/CYM, ยาสีฟันกับ Cetylpyridinium Chloride (CPC) และ Cymenol (CYM) เป็นส่วนผสมหลัก MFP, ยาสีฟันที่มีโซเดียม monofluorophosphate (MFP)
ความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์หลังจากใช้ยาสีฟัน
ระดับไฟลัม
โดยรวมแล้วไม่พบความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติใน phyla ที่แตกต่างกันระหว่างกลุ่ม (ความแตกต่างระหว่างกลุ่ม) และไม่เริ่มต้น (P> 0.05) หรือในการเยี่ยมชมครั้งสุดท้าย (P> 0.05) ในแง่ของความแตกต่างของ intragroup หลังจากใช้ยาสีฟัน CPC/CYM desulfobacterota และ คลอโรฟิลออกอตา – หลังจากการใช้ยาสีฟัน MFP เพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ เครื่องรางและ verrucomicrobiotaและลดลงอย่างมีนัยสำคัญ Patescibacteria และ Chloroflexot ถูกสังเกต (รูปที่ 3)
การเปลี่ยนแปลงในความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์ของ phyla ที่มีความอุดมสมบูรณ์> 0.05% กลุ่มการรักษา: CPC/CYM, ยาสีฟันกับ Cetylpyridinium Chloride (CPC) และ Cymenol (CYM) เป็นส่วนผสมหลัก MFP, ยาสีฟันที่มีโซเดียม monofluorophosphate (MFP) BL: พื้นฐาน; 6W: 6 สัปดาห์ *: ความแตกต่างของ intragroup อย่างมีนัยสำคัญใน CPC/CYM; †: ความแตกต่างของ intragroup อย่างมีนัยสำคัญใน MFP
ระดับสกุล
ความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์ที่ระดับสกุลโดยยาสีฟันและการเยี่ยมชมแสดงอยู่ในแผนที่ความร้อน (ดูรูปที่ 2 เพิ่มเติม); และการเปลี่ยนแปลงในสกุลที่มีความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์> 1% แสดงในรูปที่ 4
การเปลี่ยนแปลงในความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์ของสกุลที่มีความอุดมสมบูรณ์> 1% กลุ่มการรักษา: CPC/CYM, ยาสีฟันกับ Cetylpyridinium Chloride (CPC) และ Cymenol (CYM) เป็นส่วนผสมหลัก MFP, ยาสีฟันที่มีโซเดียม monofluorophosphate (MFP) BL: พื้นฐาน; 6W: 6 สัปดาห์ *: ความแตกต่างของ intragroup อย่างมีนัยสำคัญใน CPC/CYM; †: ความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญ intragroup ใน MFP §: ความแตกต่างระหว่างกลุ่มอย่างมีนัยสำคัญในสัปดาห์ที่ 6
ในการเยี่ยมชม 6 สัปดาห์พบความอุดมสมบูรณ์ที่สูงขึ้นอย่างมีนัยสำคัญในกลุ่ม CPC/CYM เมื่อเทียบกับกลุ่ม MFP ในสกุล Granulicatella– Mycoplasma – Roseburia และ อัลคาลิซึม– และความอุดมสมบูรณ์ที่ลดลงอย่างมีนัยสำคัญใน แลคโตค็อคคัส– Staphylococcus– Pseudoramibacter– Lachnospiraceaeไม่มีการเพาะปลูก ผู้สมัคร Riegeria และ การรวมตัวกัน – การเปลี่ยนแปลงของจำพวกที่เพิ่มขึ้นหรือลดลงจากพื้นฐานเป็น 6 สัปดาห์สำหรับทั้งสองกลุ่มจะแสดงในตารางเสริม 2
ระดับสปีชีส์
ในการเยี่ยมชมครั้งสุดท้ายพบความอุดมสมบูรณ์ที่สูงขึ้นอย่างมีนัยสำคัญในกลุ่ม CPC/CYM เมื่อเทียบกับกลุ่ม MFP ใน Prevotella Bisto – Prevotellaspp., Granulicatella spp., แบคทีเรีย Lachnospiraceae – ชวาร์ตเซียspp. และ SaccharimaDaceaespp .; และความอุดมสมบูรณ์ที่ต่ำกว่าใน Capnocytophaga granulosa– capnocytophaga leadbetteriไม่ได้เพาะปลูก capnocytophagaไม่ได้เพาะปลูก Belyseella– campylobacter rectus– Staphylococcusspp., Pseudoramibacterspp., ตะขาบแบคทีเรียที่ไม่มีการเพาะปลูก TM7X ไม่มีการเพาะปลูก ผู้สมัคร– ผู้สมัครRiegeria แบคทีเรียที่ไม่มีการเพาะปลูกและ Alishewanellaไม่ได้เพาะปลูก Rheinheimera– รูปที่ 5 แสดงการเปลี่ยนแปลงของสปีชีส์ที่มีความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์มากกว่า 1% การเปลี่ยนแปลงของสปีชีส์ที่เพิ่มขึ้นหรือลดลงจากพื้นฐานไปสู่การเยี่ยมชม 6 สัปดาห์สำหรับทั้งสองกลุ่มมีรายละเอียดในตารางเสริมที่ 3
การเปลี่ยนแปลงในความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์ของสปีชีส์ที่มีความอุดมสมบูรณ์> 1% กลุ่มการรักษา: CPC/CYM, ยาสีฟันกับ Cetylpyridinium Chloride (CPC) และ Cymenol (CYM) เป็นส่วนผสมหลัก MFP, ยาสีฟันที่มีโซเดียม monofluorophosphate (MFP) BL: พื้นฐาน; 6W: 6 สัปดาห์ *: ความแตกต่างของ intragroup อย่างมีนัยสำคัญใน CPC/CYM; †: ความแตกต่างของ intragroup อย่างมีนัยสำคัญใน MFP